POS机扫码微信支付宝收款是有手续费的，一般费率0.38%左右。其实POS机交易方式分为线上和线下，刷卡机刷卡属于线下交易对接银联清算，而刷卡机扫码交易属于线上交易对接网联清算。
通常POS机扫码支付分为主扫或被扫，生成二维码让持卡人支付是主扫，商户拿POS机持卡人二维码是被扫。POS机扫码支付类型可以是微信钱包或支付宝钱包，也可能是信用卡，也有可能是银行卡，各种聚合码可能都有。POS机聚合扫码支付功能，尤其是扫码信用卡支付的时候，跟直接刷信用卡效果差不多是一样的，其实是间联了微信或支付宝平台实现的支付，也是目前主流的支付方式之一。
一、要不要手续费
如果使用POS机进行微信支付宝二维码扫码收款，收取的手续费费率一般为0.38%，交易1000元手续费为3.8元。POS机所属的第三方支付机构与微信支付宝所属的第三方支付机构的支付通道对接是属于间联合作，通常微信支付宝平台放出来的结算成本为0.2%，算上网联结算成本和POS机品牌方运营成本以及机具布放市场推广成本，一般终端费率在0.38%左右。
二、哪些POS机支持微信支付宝扫码
1.一般老式的传统POS机以及固定刷卡机，是不支持微信支付宝扫码支付的，仅支持刷卡交易，通常这种情况下可以通过新增聚合收款台卡的方式来支持扫码支付收款；
2.如果是新款传统POS机或智能机以及电签机，一般系统都融合了聚合支付功能，都带有摄像头扫码功能支持微信支付宝等扫码支付。
